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基因組DNA去污劑實驗步驟

發(fā)布時間:2024-04-10      點擊次數(shù):294

基因組DNA去污劑實驗步驟:

(1)實驗開始前將RNA提取液于65℃水浴鍋中預(yù)熱,離心管中加入ME(巰基乙醇),(10mL加80ul,50mL中加入300ul)

(2)取約0.8g菌絲體(液體培養(yǎng)獲得的菌絲用真空抽濾即可!固體培養(yǎng)就更好說了),在液氮中迅速磨成精細(xì)粉末,裝入50mL離心管,按1g材料8mL的量加入預(yù)熱的RNA提取液,顛倒混勻  

(3)65℃水浴3-10 min,期間混勻2-3次

(4)加入等體積的酚(注意是酸酚pH4.5)::異戊醇(25:24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(5)取上清,等體積的:異戊醇(24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(6)加入1/4V體積10M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或過夜)

(7)10,000rpm,4℃離心20min

(8)棄上清,用500ul SSTE溶解沉淀

(9)酚::異戊醇(25:24:1)抽提兩次,:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃,5min)

(10)加2V體積的無水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上

(11)12,000rpm,4℃離心20 min

(12)棄上清.沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥

(13)加200ul的DEPC處理水溶解

(14)用非變性瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計掃描檢測RNA的質(zhì)量

(在抽提過程中,若蛋白質(zhì)含量或其它的雜質(zhì)還較多,可以增加抽提次數(shù))

本品采用非酶法清除RNA樣品中的基因組DNA污染。每ml試劑處理~100μg RNA樣品。很多用戶在提取RNA的時候由于操作因素或者RNA抽提試劑質(zhì)量問題,造成所得到的RNA樣品中混雜基因組污染,在普通或者變性電泳的時候直接肉眼可見程度不一的DNA污染雜帶。即使用市售的RNase-free的DNase消化DNA也不容易清除完全,而且常常導(dǎo)致RNA降解。本品不含DNA酶,在烈抑制RNA酶的條件下徹底清除RNA樣品中的污染DNA雜帶和蛋白質(zhì)污染,同時進(jìn)一步純化RNA。后通過異丙醇沉淀回收的RNA純度極高,完全不影響原有RNA質(zhì)量和下游應(yīng)用。

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